1. 质粒浓度检测
如果说最基本的,当然是
载体、目的基因、宿主细胞和工具酶
恩,就这么简单,最基本的
如果你要实际操作的话,以质粒基因工程改造酵母菌为例(需要的设备材料用粗体标注):
首先移液管/移液器+无菌枪头
是必备物品
你需要含有质粒的细菌
(一般是大肠杆菌),将它在超净工作台
中接种在培养细菌的液体培养基
中(一般是LB培养基),在恒温摇瓶柜
里摇瓶培养到足够浓度,用质粒抽提盒(试剂盒)+离心机
将细菌溶解,沉降掉蛋白质、拟核和其他杂质,提取出来质粒,其中还需要使用60°C恒温鼓风箱和37°C恒温培养箱
,再用光度计
测质粒浓度。
将提取出来的质粒加入限制性核酸内切酶
以及Buffer(酶发挥活性所需环境缓冲液)
,置于37°C水浴锅
中保温,至于保温多久看多贵的酶了。
保温结束后,使用DNA柱回收试剂盒
和离心机将切好的质粒回收,去掉酶和其他东西。再加入用同样方法切割好的、具有相同黏性末端的目的基因
,DNA连接酶
和Buffer
,置于16°C培养箱
水浴培养,时间也是看酶多贵。
取细菌(大肠杆菌)制备感受态细菌
保存于-70°C冰箱
中,制备过程不赘述,其中需要使用冷冻离心机
。用同样方法柱回收连接产物并加入在冰上解冻的感受态细菌悬液中,42°C水浴锅
热击90秒再置于冰上,加入LB液体培养基并置于恒温摇瓶柜培养使细菌恢复生长。
制备含抗生素(一般是氨苄青霉素)的LB固体培养基
并倒在培养皿
中冷却,用涂布棒
将大肠杆菌涂到平板上倒置于37°C培养箱培养,筛选出转化成功含有氨苄抗性基因的大肠杆菌。挑取部分单菌落置于添加了Loading(染色剂)、热稳定DNA聚合酶、Buffer、dNTP、引物RNA
的PCR小管
中,在PCR仪
中扩增。
制备琼脂糖和TAE缓冲液配比并添加DNA染色剂(接触毒性)
做的核酸凝胶
,将PCR产物和Marker(条带大小的指示剂)
点样在凝胶中用核酸凝胶电泳仪
检测含有目的基因质粒的是哪一个菌落
确定是哪个菌落后,挑取该菌落接种在新的LB液体培养基中摇瓶培养,用同样的方法提取重组质粒,制备感受态酵母菌
并将重组质粒加入转化。
制备含抗生素(同上)的YPD固体培养基
并将转化产物涂布在平板上筛选,并进行PCR验证或进一步验证它的目的基因表达产物即可。基因工程的操作到这基本就算完了。
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如果是动植物细胞,也就是转化的方式有所不同,比使Ti质粒转座子、基因枪、显微注射、病毒侵染等。
以上是我们实验室的操作方法,实验室不同甚至预算不同都会引起方法有略微的差别。比如有一些繁琐的步骤只要买一个试剂盒就能解决,但是试剂盒也不便宜就是了。
如果你要了解,那这些基本够了
如果你要亲手实践一下,劝你还是联系实验室吧,毕竟这些东西就算土豪也肉疼……
2. 质粒浓度测定
气溶胶质粒:匀和层内除气体成分外,悬浮着大量气溶胶质粒,其含量和分布随时间、地点、天气条件而变。大气气溶胶质粒的总浓度一般是低空多、高空少,陆地多、海上少,城市多、乡村少。它们使能见度变坏,影响辐射传输,有的能起凝结核的作用。
3. 质粒浓度检测仪器
气溶胶质粒:匀和层内除气体成分外,悬浮着大量气溶胶质粒,其含量和分布随时间、地点、天气条件而变。大气气溶胶质粒的总浓度一般是低空多、高空少,陆地多、海上少,城市多、乡村少。它们使能见度变坏,影响辐射传输,有的能起凝结核的作用。
4. 质粒浓度检测仪器微型
不是260/230,是260/280,如果比值是1.7的话,那说明样品里面还有蛋白,有可能是菌体量太大,也可能和试剂盒质量有关系,一般质粒小抽的试剂盒产量都不是很高的,浓度有100ng/ul就不错了。
5. 质粒浓度检测峰图
1、利用氯霉素抑制染色体的复制,而不抑制质粒的复制这一特点,在低拷贝质粒(如pUC19)的培养过程中添加氯霉素可以大大提高得率。
2、RNA 的去除,首先是使用 RNase 消化。在溶液 I 中加入高浓度的 RNase A (100ug/ml),或者用含 25ug RNase A/ml TE 溶解抽提好的质粒,都可以降低 RNA 残留,但都不能彻底去除。
3、蛋白质的去除,主要是靠不溶解的 K-SDS-蛋白质复合物的形成。虽然将中和后的体系置于 4C 一段时间,可以形成更多的该不溶复合物,从而使蛋白质残留更少,但实践证明这样做并不是必须的,除非是大量抽提。 首先,质粒的提取可分为质粒小提、质粒中提、质粒大提。目前大多数实验室都选用试剂盒进行提取,可以根据实验的不同需求,选择相应的试剂盒。 质粒小提主要用于用于大肠杆菌中质粒DNA的小量提取,获得的质粒可以用于常规的载体构建,一般适用于5ml以下菌液。 而质粒中提,在小提的基础上可以进一步去除菌液中的内毒素,获得的质粒可以用于细胞转染,常规需要菌液量为10-15ml。质粒大提与中提方法相同,可一次抽提100ml-300ml菌液获得大量质粒。
6. 质粒浓度测定正常范围是多少
稀释一定的浓度梯度,粗定量方法:跑琼脂糖胶,跟Marker对比,估算量 可以使用分光光度计,在260和280nm测吸光度,计算得到比较精确值
7. 质粒浓度检测方法学验证
一般来说10~100ng都可以,不过其实我们真正做的时候就是不管浓度多大(浓度约在100ng/ul以上),都是取1ul的质粒溶液,稀释10倍,就是10ul,加入到100ul的感受态细胞里~1、“切开的质粒”等于“线性dna”。
2、“线性dna转化细菌、以及真菌的原生质体”已经成功。
所以,切开的质粒能转化进入感受态细菌。但是,不能复制。如果质粒上带有与细菌染色体上同源序列,质粒可以重组交换到细菌染色体上。例如构建突变或增加外源基因等。